Bei Klappschildkröten lässt sich das Geschlecht am einfachsten und am sichersten anhand des Schwanzes unterscheiden: Männchen haben einen deutlich dickeren und längeren Schwanz als die Weibchen. Dadurch ist bei ausgestrecktem Schwanz die Kloake bei Männchen außerhalb des Panzers und näher an der Schwanzspitze, bei Weibchen ist diese nah am Panzer.
Des Weiteren haben männliche Klappschildkröten Haftpolster auf der Innenseite der Hinterbeine. Durch die Polster haben sie einen besseren Halt, wenn sie zur Paarung beim Weibchen aufreiten.
Außerdem lassen sich die Geschlechter meist anhand des Bauchpanzers unterscheiden: Männchen haben einen nach innen gewölbten (konkaven) Bauchpanzer (Plastron), während er bei Weibchen flach ist. Jedoch ist dieses Merkmal nicht immer so deutlich ausgeprägt wie bei diesen Herreras Klappschildkröten (Kinosternon herrerai).
Die Krallenlänge ist bei Klappschildkröten kein Unterscheidungsmerkmal: Männchen und Weibchen haben kurze Krallen.
Jedoch gibt es Arten, bei denen sich die Kopffärbung zwischen Männchen und Weibchen unterscheidet, wie beispielsweise bei der Tabasco-Klappschildkröte (Kinosternon acutum). Dieses Kriterium trifft allerdings nicht auf alle Arten zu.
Jungtiere
Leider ist es bei Jungtieren noch nicht möglich, das Geschlecht zu bestimmen. Eine sichere Geschlechtsbestimmung ist bei Klappschildkröten erst ab etwa 6-8 cm Panzerlänge möglich – das hängt dann auch von der Endgröße der Tiere ab.
Als Jungtier sehen alle Klappschildkröte aus wie Weibchen. Der große Schwanz, an denen Du ein Männchen erkennst, entwickelt sich erst später.
Wenn Du Deine junge Klappschildkröte bei einem verantwortungsvollen Züchter erwirbst, so kann er eventuell doch eine wage Vorhersage machen, welches Geschlecht Deine Wasserschildkröte hat. Denn bei Klappschildkröten hängt das Geschlecht von der Bruttemperatur ab. So schlüpfen bei 25-26,5 °C mehr Männchen als Weibchen, wohingegen sich bei 28-30 °C mehr Weibchen in den Eiern entwickeln.
Halbwüchsige
Auf dem obigen Bild seht ihr den Unterschied zwischen halbwüchsigen Skorpions-Klappschildkröten (Kinosternon scorpioides scorpioides) beiden Geschlechts. Der Schwanz des Männchens ist bereits jetzt fast doppelt so lang wie der des Weibchens. Außerdem ist er im Ansatz deutlich dicker. Auch der Hornnagel an der Spitze des Schwanzes ist gut zu erkennen. Zugegeben: Im direkten Vergleich ist es natürlich besser zu erkennen als bei nur einem Tier.